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OpenMX Viewer:一个基于 Web 的晶体与分子图形用户界面程序

人机交互 2019-04-09 v1 材料科学

摘要

OpenMX Viewer(Material eXplorer 开源包查看器)是一个基于 Web 的图形用户界面(GUI)程序,用于以 Gaussian cube 格式(如电子密度和分子轨道)可视化和分析晶体与分子结构以及 3D 网格数据。该基于 Web 的 GUI 程序使我们能够通过拖放 XYZ、CIF 或 OpenMX 输入/输出文件快速可视化晶体与分子结构,并在 Web 浏览器中便捷分析静态/动态结构性质。包含了若干基本功能,如 Mulliken 电荷分析、分子动力学、几何优化和能带结构。此外,基于 marching cubes、marching tetrahedra 和 surface nets 算法及仿射变换,支持 3D 等值面技术,以 cube 格式可视化电子密度和分子/晶体轨道,并叠加晶体或分子结构。进一步实现了能带结构查看器,用于在 Web 浏览器中显示能带结构。通过访问 OpenMX Viewer 网站,用户始终可使用最新版 OpenMX Viewer 来可视化各种结构并分析其性质,无需安装、升级、更新、注册、登录和终端命令。

关键词

引用

@article{arxiv.1904.03992,
  title  = {OpenMX Viewer: A web-based crystalline and molecular graphical user interface program},
  author = {Yung-Ting Lee and Taisuke Ozaki},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1904.03992},
  year   = {2019}
}

备注

16 pages, 4 figures