用于体积光片显微数据实时去斜与活体观测的开源软件包
图像与视频处理
2022-11-03 v1
摘要
斜平面显微镜（OPM）是一种光片显微镜，可对生物样本进行高时间分辨率与高空间分辨率的体积成像。然而，OPM及相关的光片显微镜变体的成像几何结构，会使所呈现图像截面的坐标系相对于样本移动以导航至感兴趣区域时的真实空间坐标系发生畸变。这使得此类显微镜的活体观测与实际操作十分困难。我们提出一个利用GPU加速与多进程处理的开源软件包，可实时变换OPM成像数据的显示，生成模拟标准宽场显微镜所产生图像的活体视图。图像栈的采集、处理与绘制速率可达数Hz，使OPM及类似显微镜的活体操作更加友好直观。
引用
@article{arxiv.2211.00645,
title = {An open-source software package for on-the-fly deskewing and live viewing of volumetric lightsheet microscopy data},
author = {Jacob R. Lamb and Edward N. Ward and Clemens F. Kaminski},
journal= {arXiv preprint arXiv:2211.00645},
year = {2022}
}