OpenCFU:一款用于计数细胞菌落及其他圆形物体的新型免费开源软件
定量方法
2012-12-14 v3 计算机视觉与模式识别
摘要
计数细胞菌落等圆形物体是生物学家获取信息的重要来源。尽管这项任务通常耗时且主观,但目前仍主要以人工方式进行。本研究旨在提供一种从数字图片和视频流中枚举圆形物体的新工具。在此,我证明了所开发的程序 OpenCFU 非常稳健、准确且快速。此外,它提供了对处理参数的控制,并实现了直观且现代化的界面。OpenCFU 是一款跨平台开源软件,可在 http://opencfu.sourceforge.net 免费获取。
引用
@article{arxiv.1210.5502,
title = {OpenCFU, a New Free and Open-Source Software to Count Cell Colonies and Other Circular Objects},
author = {Quentin Geissmann},
journal= {arXiv preprint arXiv:1210.5502},
year = {2012}
}