生物网络最大熵模型中成对相互作用的充分性
定量方法
2016-03-23 v1 统计力学
生物物理
摘要
生物信息处理网络由许多组分构成，这些组分通过更大量的复杂多变量相互作用耦合。然而，来自神经科学、分子生物学和行为学等不同领域的数据集分析表明，一些生物网络的状态观测统计可以很好地用仅包含组分间成对相互作用的最大熵模型来近似。基于具有 -spin () 相互作用的随机伊辛自旋网络模拟，我们认为这种复杂性的降低可被视为密集相互作用网络在特定状态下的自然属性，而不一定是生命系统的特殊性质。通过将我们的分析与随机约束满足问题理论相联系，我们提出了某些生物系统可能在此状态下运作的原因。
引用
@article{arxiv.1505.02831,
title = {On the sufficiency of pairwise interactions in maximum entropy models of biological networks},
author = {Lina Merchan and Ilya Nemenman},
journal= {arXiv preprint arXiv:1505.02831},
year = {2016}
}