论细胞的递归生产与可进化性：催化反应网络方法

为了从化学反应动力学的水平揭示细胞的逻辑，我们需要阐明化学物质的集合如何自主地产生化学物质集合，而不假设特定的外部控制机制。细胞由大量相互催化的化学物种组成。通常每个分子物种的数量不是很大，因此每个分子物种的数量波动可能很大。在这种多样性和大波动的环境中，细胞如何实现递归生产？另一方面，细胞可以在更长的时间跨度内改变其状态以进化成不同的类型。繁殖和进化如何兼容？我们基于催化反应网络的几个模型研究来解决这些问题。在这篇综述论文中，我们首先阐述了关于细胞递归性和可进化性的基本问题，然后阐述了我们回答这些问题的研究立场，即所谓的“建构生物学”。基于这一立场，我们提出了将细胞建模为化学反应网络的总体策略。