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老药用于新发病毒性疾病 COVID-19 的生物信息学展望

生物大分子 2020-03-11 v1

摘要

2019 年末和 2020 年的冠状病毒(COVID-19)爆发构成了全球范围内严重的、更可能为大流行的威胁。鉴于该疾病迄今尚无获批疫苗或药物,在此情形下,基于老药作用机制的任何药物设计努力或临床试验都是值得且可信的。利用新发布的 COVID-19 蛋白酶坐标结构作为受体、并从抗病毒和抗生素药物中精心挑选化学物质作为配体进行经验对接实验,可能在此方面具有引领作用。我们基于化学结构从 HIV-1 蛋白酶抑制剂中选取了九种药物,从抗支气管炎药物中选取了二十一种候选物,并以不同模式及类天然相互作用条件将其纳入盲对接与活性位点定向对接。我们的发现表明,候选物的结合能力与抑制效力依次为:HIV-1 蛋白酶抑制剂中 Tipranavir>Indinavir>Atazanavir>Darunavir>Ritonavir>Amprenavir,抗支气管炎药物中 Cefditoren>Cefixime>Erythromycin>Clarithromycin。药物的生物利用度、疏水性及其结合位点的疏水性质,以及它们在人体内的代谢与失活速率,是其对病毒感染总体效应的后续决定因素;这些净结果应通过临床试验评估,以判断其对冠状病毒感染的治疗效用。

关键词

引用

@article{arxiv.2003.04524,
  title  = {Old Drugs for Newly Emerging Viral Disease, COVID-19: Bioinformatic Prospective},
  author = {Mohammad Reza Dayer},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2003.04524},
  year   = {2020}
}

备注

16 pages, 3 Figures, 3 Tables, New Results