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周期性与无序 DNA 中的非线性电荷输运机制

斑图形成与孤子 2015-06-26 v1 软凝聚态物质

摘要

我们研究了一种沿 DNA 分子的类极化子电荷输运机制模型,重点考察参数无序与结构无序的影响。我们的模型哈密顿量考虑了电荷载流子与两类不同模式的耦合,这两类模式分别代表 λ-DNA 双螺旋结构中碱基对的涨落扭转运动以及氢键畸变。利用非线性映射方法,针对周期性双螺旋以及反映周围溶剂坐标影响的本征静态参数和/或结构无序,构造了局域定态。结果表明,电荷输运由运动极化子亦即呼吸子复合物所介导,它们不仅携带电荷,而且通过行进来扭转与键呼吸子分量引起螺旋结构的局域暂时形变,从而阐释了生物分子中结构与功能的相互作用。

关键词

引用

@article{arxiv.nlin/0301039,
  title  = {Nonlinear charge transport mechanism in periodic and disordered DNA},
  author = {D. Hennig and J. F. R. Archilla and J. Agarwal},
  journal= {arXiv preprint arXiv:nlin/0301039},
  year   = {2015}
}

备注

23 pages, 13 figures