周期性与无序 DNA 中的非线性电荷输运机制
斑图形成与孤子
2015-06-26 v1 软凝聚态物质
摘要
我们研究了一种沿 DNA 分子的类极化子电荷输运机制模型,重点考察参数无序与结构无序的影响。我们的模型哈密顿量考虑了电荷载流子与两类不同模式的耦合,这两类模式分别代表 λ-DNA 双螺旋结构中碱基对的涨落扭转运动以及氢键畸变。利用非线性映射方法,针对周期性双螺旋以及反映周围溶剂坐标影响的本征静态参数和/或结构无序,构造了局域定态。结果表明,电荷输运由运动极化子亦即呼吸子复合物所介导,它们不仅携带电荷,而且通过行进来扭转与键呼吸子分量引起螺旋结构的局域暂时形变,从而阐释了生物分子中结构与功能的相互作用。
引用
@article{arxiv.nlin/0301039,
title = {Nonlinear charge transport mechanism in periodic and disordered DNA},
author = {D. Hennig and J. F. R. Archilla and J. Agarwal},
journal= {arXiv preprint arXiv:nlin/0301039},
year = {2015}
}
备注
23 pages, 13 figures