DNA分子线中的结构涨落与量子输运：一种结合分子动力学与模型哈密顿量的方法
软凝聚态物质
2015-05-14 v1 材料科学
摘要
利用一种结合量子力学电子结构计算、经典分子动力学模拟和模型哈密顿量方法的混合计算技术，研究了存在结构涨落时通过短 DNA 寡聚体（Dickerson 十二聚体）的电荷输运。基于片段轨道描述，DNA 电子结构可以非常高效地被粗粒化。通过沿分子动力学轨迹的快照评估的有效 DNA 电子参数的时间序列，可以直观地考虑由溶剂涨落或碱基对振动模式引起的动力学涨落的影响。我们表明，通过与溶剂涨落的耦合可以促进电荷输运，该涨落对 DNA 分子线沿线的在位能进行门控。
引用
@article{arxiv.0910.0348,
title = {Structural fluctuations and quantum transport through DNA molecular wires: a combined molecular dynamics and model Hamiltonian approach},
author = {R. Gutierrez and R. Caetano and P. B. Woiczikowski and T. Kubar and M. Elstner and G. Cuniberti},
journal= {arXiv preprint arXiv:0910.0348},
year = {2015}
}