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非平衡传感及其与动力学校对的类比

生物物理 2015-05-29 v2 统计力学 分子网络

摘要

对于一个趋化性的范式模型,我们分析了驱动受体离开平衡的非零亲合势如何影响灵敏度。每当受体活性变化涉及ATP水解时,就会出现这种亲合势。灵敏度在配体浓度区间上的积分被证明受亲合势增强,提供了一种能量消耗改善传感的度量。借助该积分灵敏度,我们能在非平衡受体传感与动力学校对之间建立有趣的类比:积分灵敏度的增加等价于动力学校对中的误差的减少。受体占据对磷酸化和去磷酸化反应速率的影响被证明对积分灵敏度与亲合势之间的关系至关重要。这种影响甚至可能导致非零亲合势降低积分灵敏度的机制,对应于反校对。

关键词

引用

@article{arxiv.1502.02594,
  title  = {Nonequilibrium sensing and its analogy to kinetic proofreading},
  author = {David Hartich and Andre C. Barato and Udo Seifert},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1502.02594},
  year   = {2015}
}

备注

17 pages, 7 figures