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非平衡系统中的鉴别性校对机制

统计力学 2014-04-30 v2 分子网络

摘要

我们利用源自生物学校错机制的动力学校对思想,来识别非平衡系统中的新动力学区间。这些区间由系统状态占据数对其能量变化的敏感度所定义。在生物学背景下,更高的敏感度对应于在同一反应中竞争的不同能量分子底物之间更强的鉴别能力。我们研究了这种鉴别能力在具有离散状态且通过一般跃迁网络相连的系统中的表现。我们发现,当网络中给定状态的能量变化时,存在多种具有不同鉴别能力的区间。有趣的是,状态的占据数甚至可能随其能量增加而增加,这对应于一种“反校对”区间。此类鉴别区间的数量和性质受网络拓扑结构的限制。最后,我们发现无需修改系统的任何“硬连线”结构方面,仅通过改变外部化学势即可改变鉴别区间。

关键词

引用

@article{arxiv.1312.2286,
  title  = {Discriminatory proofreading regimes in non-equilibrium systems},
  author = {Arvind Murugan and David A Huse and Stanislas Leibler},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1312.2286},
  year   = {2014}
}

备注

7 pages, 5 figures, edited version published in PRX