网络拓扑作为lac操纵子双稳态的驱动因素
分子网络
2015-01-28 v1
摘要
大肠杆菌中的lac操纵子已被广泛研究，并且是最早被发现同时受到正控制和负控制的基因系统之一。已知lac操纵子表现出双稳态，即操纵子要么被诱导，要么未被诱导。已经提出了许多动力学模型来捕捉这一现象。虽然大多数基于复杂的数学公式，但有人提出，对于其他基因系统，网络拓扑足以产生所需的动力学行为。我们提出了一个布尔网络作为lac操纵子的离散模型。我们在模型中包含了分解代谢物阻遏和诱导物排除这两种主要的葡萄糖控制机制，并表明它表现出双稳态。此外，我们提出了一个简化模型，表明lac mRNA和乳糖构成了lac操纵子的核心，并且该简化模型也表现出相同的动力学。这项工作证实了动力学性质的关键在于网络拓扑和相互作用的符号这一主张。
引用
@article{arxiv.0807.3995,
title = {Network Topology as a Driver of Bistability in the lac Operon},
author = {Brandilyn Stigler and Alan Veliz-Cuba},
journal= {arXiv preprint arXiv:0807.3995},
year = {2015}
}
备注
15 pages, 13 figures, supplemental information included