网络模块有助于识别细胞及其他网络中的关键运输路径和信号通路
生物物理
2010-10-05 v2 分子网络
摘要
复杂系统通过网络概念被成功地简化为相互作用的元素。运输在网络生存中起着关键作用。例如，细胞网络中专门的信号级联能够过滤噪声并有效地使网络结构适应新的刺激。然而，我们对复杂系统中运输机制和信号通路的总体理解仍然有限。在此，我们总结了参与运输的关键网络结构，列出了过载系统可用于减轻负载的解决方案，并概述了一种可能用于计算确定信号通路的方法。我们强调，除了枢纽、桥梁和网络骨架外，重叠的模块结构在网络运输中也至关重要。此外，通过将网络元素定位在重叠网络模块的空间中并评估它们在“模块空间”中的距离，可能可以近似地计算信号通路，这反过来又有助于识别复杂系统的信号通路。我们的模型可能适用于包括交通控制或药物设计在内的广泛领域。
引用
@article{arxiv.0908.4524,
title = {Network modules help the identification of key transport routes, signaling pathways in cellular and other networks},
author = {Robin Palotai and Peter Csermely},
journal= {arXiv preprint arXiv:0908.4524},
year = {2010}
}
备注
The final version has 3 figures, 2 tables, 1 box and 40 references