模拟病毒进入细胞核的小球上小窗口的窄逃逸问题
亚细胞过程
2016-07-20 v2
摘要
某些种类的病毒若能通过众多小目标孔之一进入细胞核，并在被永久捕获或降解之前，即可在细胞内复制。我们采用切换随机过程模型来描述病毒运动，并在此估算病毒粒子存活到达细胞核的概率和条件平均首达时间。细胞核覆盖着数千个小的吸收性核孔，它们之间的最小距离定义了限制随机模拟效率的最小空间尺度。利用 Neuman-Green 函数法求解稳态 Fokker-Planck 方程，我们推导出了针对不同孔分布的小窗口到达概率和平均到达时间的渐近公式，这些公式与随机模拟结果一致。这些公式揭示了关键几何参数如何定义病毒感染的细胞质阶段。
引用
@article{arxiv.1607.02479,
title = {Narrow escape to small windows on a small ball modeling the viral entry into the cell nucleus},
author = {Thibault Lagache and David Holcman},
journal= {arXiv preprint arXiv:1607.02479},
year = {2016}
}
备注
21 pages, 2 figures