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NAPX:诺亚方舟问题的多项式时间近似方案

数据结构与算法 2008-10-27 v2

摘要

诺亚方舟问题 (NAP) 是一个与生态保护管理相关的 NP-Hard 优化问题。它要求在固定预算下最大化一组分类单元的系统发育多样性 (PD),其中每个分类单元关联着保护成本和灭绝概率。随着基因序列数据可用性的增加,PD 被用作生物多样性的实际度量,NAP 重新引起了关注。然而,文献中迄今仅解决了该问题的简化实例,即一个或多个参数被固定为常数的情况。我们提出了 NAPX,这是首个针对 NAP 通用版本的算法,可返回最优解的 1ϵ1 - \epsilon 近似。其运行时间为 O(nB2h2log2nlog2(1ϵ))O(\frac{n B^2 h^2 \log^2n}{\log^2(1 - \epsilon)}),其中 nn 是物种数量,BB 是总预算,hh 是输入树的高度。我们还提供了其期望运行时间的改进界。

关键词

引用

@article{arxiv.0805.1661,
  title  = {NAPX: A Polynomial Time Approximation Scheme for the Noah's Ark Problem},
  author = {G. Hickey and P. Carmi and A. Maheshwari and N. Zeh},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0805.1661},
  year   = {2008}
}