纳米机械共振捕获DNA解旋中的预熔化转变
软凝聚态物质
2018-09-21 v2 生物物理
生物大分子
摘要
双链DNA通过中间解链泡片段进行热解旋。本质上,泡边界处会因与环境非平衡(NE)能量交换而产生涨落。然而,此类细节在宏观尺度上被大群体动力学所掩盖,将平衡路径与解旋图景相关联。本工作中,我们在微流控悬臂梁中以皮升级样品捕获了涨落能量学的证据。我们利用纳米机械共振通过耗散测量NE能量交换,揭示了在T~42C处一个关键的预熔化转变。这意味着解旋可能经由释放能量的中间塌缩泡构象进行,所释能量足以解开泡端,协助进一步解绑。涨落定理解释了这些观测,为研究其他也经由类似NE能量学进行的生物现象中的涨落动力学开辟了进一步途径。
引用
@article{arxiv.1806.00073,
title = {Nanomechanical resonance captures pre-melting transition in DNA unravelling},
author = {Keren Jiang and Faheem Khan and Javix Thomas and Arindam Phani and Thomas Thundat},
journal= {arXiv preprint arXiv:1806.00073},
year = {2018}
}
备注
Manuscript and Supplementary Information