利用 ALEX-FRET 监测单个钾转运蛋白的构象动力学
生物物理
2009-11-13 v1 数据分析、统计与概率
摘要
单蛋白的构象变化可通过 Förster 型共振能量转移 (FRET) 进行实时监测。必须将两种不同的荧光团连接到在功能过程中发生移动的那些蛋白质结构域上。荧光团之间的距离是通过测量 FRET 供体和受体荧光团的相对荧光强度变化，或通过测量 FRET 供体的荧光寿命变化来确定的。单个 FRET 供体荧光团的荧光光谱受局部蛋白质环境动力学的影响，导致 FRET 供体和受体检测通道上出现表观荧光强度变化。为了区分这些光谱波动与依赖于距离的 FRET，最近引入了交替脉冲激发方案 (ALEX)，该方案可同时探测 FRET 受体荧光团的存在。在此，我们将单分子 FRET 测量应用于膜蛋白。嵌入膜中的 KdpFABC 复合物利用 ATP 水解将钾离子跨脂质双层转运。我们的研究旨在通过单分子 FRET 和隐马尔可夫模型 (Hidden-Markov-Models) 分析，观察功能重组到脂质体中的单个 P 型 ATPase 内的构象波动。
引用
@article{arxiv.0801.2059,
title = {Monitoring the conformational dynamics of a single potassium transporter by ALEX-FRET},
author = {N. Zarrabi and T. Heitkamp and J. C. Greie and M. Boersch},
journal= {arXiv preprint arXiv:0801.2059},
year = {2009}
}
备注
10 pages, 4 figures