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稀释池检测的改进Dorfman流程——COVID-19案例研究

统计方法学 2020-12-16 v2 应用统计

摘要

全球COVID-19大流行的爆发导致对大量患者进行SARS-CoV-2冠状病毒存在检测的快捷高效需求空前。除提高个体检测成本与速度的技术改进外,池检测可用于提升群体检测的效率与通量。Dorfman池检测流程是此类最著名且被充分研究的方法之一。然而,该流程基于不现实的假设,即池检测具有完美灵敏度且唯一目标是最小化检测次数,并不能很好适应不完美池检测的情形。我们提出并分析了对该流程的一个简单改进,即对结果为阴性的池独立重复检测至多若干次。所提流程在一项使用近期SARS-CoV-2 PCR检测稀释效应数据的计算研究中被评估,显示该方法以相对较小的检测次数增加显著减少了假阴性数量,尤其在低患病率下。例如,在患病率0.001时,检测次数可降至个体检测的22.1%,假阴性期望数增加不超过1%;降至个体检测的16.8%,假阴性期望数增加不超过10%。同时,标准Dorfman流程中类似的期望检测次数减少将分别导致假阴性期望数增加675%和821%。这使得所提流程成为如COVID-19等疾病筛查检测的有趣选择。

关键词

引用

@article{arxiv.2012.00673,
  title  = {Modified Dorfman procedure for pool tests with dilution -- COVID-19 case study},
  author = {Andrzej Jaszkiewicz},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2012.00673},
  year   = {2020}
}