基于一般分支过程框架模型 novel 病原菌株的随机导入动力学与建立
种群与进化
2024-12-02 v2 概率论
定量方法
摘要
病原菌株的导入及其随后在种群中的建立由于疾病动力学的随机性，面临很大不确定性。数学模型需要考虑暴发早期的随机性，以充分捕捉疾病预测中的不确定性。我们提出一种一般分支过程模型的疾病传播，包括宿主水平的异质性，并且可以根据特定的疾病暴发情况进行调整。我们将其与通过独立的标记泊松过程发生的病例导入模型相结合。我们利用该框架来研究不同控制策略的影响，特别是针对外来病原菌株建立时间，使用来自文献的 COVID-19 参数作为示例。我们还演示了如何将模型与确定性近似相结合，以生成仍然包含暴发早期不确定性的中长期预测。我们的ethods 能够在模型参数仍不确定且随机性对种群动力学具有较大影响时，产生有意义的短期和中期疾病暴发进程预测。
引用
@article{arxiv.2405.02379,
title = {Modelling the Stochastic Importation Dynamics and Establishment of Novel Pathogenic Strains using a General Branching Processes Framework},
author = {Jacob Curran-Sebastian and Frederik Mølkjær Andersen and Samir Bhatt},
journal= {arXiv preprint arXiv:2405.02379},
year = {2024}
}