将生态群落建模为 DNA
定量方法
2014-04-01 v1 种群与进化
摘要
生态学家致力于理解和预测生态群落随时间的变化。虽然通过物种丰度的变化来衡量这一点看似自然，但计算限制使得人们通常转而模拟群落类型之间的转换。我们提出了一种受 DNA 替换模型启发的方法，旨在估算物种间的历史相互作用，从而估算生态群落中的更替率。尽管我们的模拟显示该方法存在一些局限性，但将其应用于蝴蝶群落数据表明，该方法能够检测真实数据中的信号。实现该方法的开源 C++ 代码可在 http://www.github.com/willpearse/lotto 获取。
引用
@article{arxiv.1403.7668,
title = {Modelling ecological communities as if they were DNA},
author = {William D. Pearse and Andy Purvis and David B. Roy and Alexandros Stamatakis},
journal= {arXiv preprint arXiv:1403.7668},
year = {2014}
}