APC/C 抑制的有效通路建模：MCC 与 BubR1 的关键作用
分子网络
2016-11-18 v1 偏微分方程分析
动力系统
细胞行为
摘要
高度保守的纺锤体组装检查点 (SAC) 确保在复制基因组的所有染色体都正确连接到有丝分裂纺锤体的微管之前，姐妹染色单体不会分离并分布到纺锤体两极。从生物化学角度看，SAC 通过阻止后期促进复合物/周期体 (APC/C) 的激活来延迟细胞周期进程；APC/C 被 Cdc20 激活是姐妹染色单体分离所必需的，这标志着向后期的过渡。响应检查点的激活，多种因子控制着 APC/C 和 Cdc20 的活性。然而，其背后的调控通路在很大程度上仍不清楚。在本研究中，构建了五种可能的 APC/C 调控模型变体，即 BubR1、Mad2、MCC、MCF2 以及一个包含所有通路的模型变体。这些模型通过文献中的实验数据进行了验证。测试了广泛的参数值范围，以寻找 APC 结合速率的临界值。结果表明，所有变体都能捕捉到 APC 的野生型行为。然而，只有同时包含 MCC 和 BubR1 作为 APC 有效抑制剂的模型变体，能够重现 APC 调控的野生型和突变型行为。本项工作利用系统生物学方法，成功区分了同一生物系统的五个相互竞争的动力学模型。此外，结果表明，系统层面的方法对分子生物学至关重要，也可用于比较相关通路，以产生假设并增进我们的理解。
引用
@article{arxiv.1611.04781,
title = {Modeling potent pathways for APC/C inhibition: pivotal roles for MCC and BubR1},
author = {Bashar Ibrahim},
journal= {arXiv preprint arXiv:1611.04781},
year = {2016}
}
备注
Journal article as preprint