对相邻化学全同荧光团中非加和效应的建模
化学物理
2022-04-22 v2 生物物理
数据分析、统计与概率
摘要
定量荧光分析常用于推导生物分子复合物的化学性质，包括化学计量。荧光数据分析中的一个基本潜在假设——无论是通过超分辨确定蛋白质复合物化学计量、通过光漂白逐步计数、还是在RNA荧光原位杂交（RNA-FISH）实验中确定衍射极限斑点中的RNA计数——是荧光团表现相同且不发生相互作用。然而，近期对荧光团标记的DNA折纸结构（如fluorocubes）的实验揭示了当全同荧光团彼此靠近时它们之间相互作用的性质，从而对荧光团不相互作用这一建模假设的有效性提出质疑。在此，我们分析脉冲照明下染料间距为2-10 nm的fluorocubes的光子到达数据。我们讨论亮度非加和性对定量荧光分析的影响。
引用
@article{arxiv.2202.07039,
title = {Modeling Non-additive Effects in Neighboring Chemically Identical Fluorophores},
author = {Ayush Saurabh and Stefan Niekamp and Ioannis Sgouralis and Steve Pressé},
journal= {arXiv preprint arXiv:2202.07039},
year = {2022}
}
备注
15 pages, 4 figures. Updated version corrects for some typos, adds figures, and updates some results without changing any conclusions