蛋白质聚集竞争路径模型：膜结合蛋白的作用
定量方法
2018-03-02 v9
摘要
受阿尔茨海默病中Aβ肽聚集这一生物学重要且复杂现象的启发，我们引入了一种用于研究蛋白质聚集的模型与模拟方法，该方法包括胞外聚集、由膜结合蛋白协助的细胞表面聚集，以及肽和蛋白质的供应、清除、产生与隔离。该模型用于生成关于聚集起始和由聚集引起的稳定Aβ单体浓度降低的平衡与动力学聚集相图。我们实施的方法允许对涉及时间尺度和浓度相差数个数量级的现象进行建模，且这种差异可在模拟中保留。我们演示了如何识别使聚集后单体浓度耗竭与阿尔茨海默病中观察到的现象相似的参数值范围。我们展示了随着反应参数和蛋白质浓度变化如何获得截然不同的行为，并讨论了协调来自两个截然不同浓度体系的实验结果的困难。后者是将体外和小鼠实验与人类相关联时的一个重要普遍问题。
引用
@article{arxiv.1107.2903,
title = {Model for competing pathways in protein-aggregation: role of membrane bound proteins},
author = {Youval Dar and Benjamin Bairrington and Daniel Cox and Rajiv Singh},
journal= {arXiv preprint arXiv:1107.2903},
year = {2018}
}