MI-Sim：用于微生物生态相互作用数值分析的 MATLAB 软件包
定量方法
2017-11-01 v1 动力系统
摘要
食物网及其他类别的生态网络模体是描述生态系统中消费者与生产者之间捕食关系的一种方式。它们在不同尺度上均有应用，区别仅在于描述系统的生物体和底层的潜在特性。在生态学中，使用机制性方法通过常微分方程组描述系统的动态行为和特性的数学建模已被广泛应用。模型允许对各种模体的动态进行模拟，而其数值分析则有助于更好地理解系统组件及其内在特性之间的相互作用。我们开发了 MI-Sim 软件用于 MATLAB，以对几种常见的生态模体进行严格且快速的数值分析。MI-Sim 包含一系列最常用的模体，如合作、竞争和捕食。它不需要对数学分析技术有详细了解，以单一图形用户界面的形式提供，包含所有输入和输出选项。当前版本 MI-Sim 中可用的工具包括模型模拟、稳态存在性与稳定性分析以及吸引域分析。该软件包含七种生态相互作用模体和七种生长函数模型。与其他系统分析工具不同，MI-Sim 被设计为专用于生态种群类型模型的简单且用户友好的工具，允许快速评估其动态和行为特性。
引用
@article{arxiv.1610.03786,
title = {MI-Sim: A MATLAB Package for the Numerical Analysis of Microbial Ecological Interactions},
author = {M. J. Wade and J. Oakley and S. Harbisher and N. G. Parker and J. Dolfing},
journal= {arXiv preprint arXiv:1610.03786},
year = {2017}
}
备注
15 pages, 3 figures