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甲基化操作向导(MeOW):长读长测序数据中差异甲基化区域的识别

基因组学 2024-02-28 v1 定量方法

摘要

长读长测序(LRS)能够在单次测序实验中同时捕获DNA序列和修饰(如CpG甲基化)的信息。本文介绍甲基化操作向导(MeOW),一个利用LRS数据在全基因组范围内识别和优先排序差异甲基化区域(DMR)的程序。MeOW可以使用包含每个核苷酸甲基化CpG位点计数的文件,或包含修饰碱基标签的bam文件运行。

关键词

引用

@article{arxiv.2402.17182,
  title  = {Methylation Operation Wizard (MeOW): Identification of differentially methylated regions in long-read sequencing data},
  author = {Miranda PG Zalusky and Danny E Miller},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2402.17182},
  year   = {2024}
}

备注

7 pages, 1 figure