生物蛋白质材料力学表征的介观模型
生物大分子
2008-07-18 v1
摘要
蛋白质分子的力学表征在深入了解蛋白质的生物学功能方面发挥了作用，因为某些蛋白质执行力学功能。在此，我们提出了由Go势描述的蛋白质晶体组成的生物蛋白质材料的介观模型，用于表征蛋白质材料的弹性行为。具体来说，我们考虑了包含由α-碳原子表示并由Go势描述的蛋白质晶体的代表性体积单元(RVE)，并对RVE施加恒定法向应变。根据维里应力理论计算的应力-应变关系提供了蛋白质材料的非线性弹性行为及其力学性能，如杨氏模量，其定量和/或定性结果可与从实验和/或原子模拟中获得的生物蛋白质材料的力学性能相比较。此外，我们讨论了天然拓扑结构对蛋白质晶体力学性能的作用。结果表明，平行链(平行氢键)增强了蛋白质材料的力学韧性。
引用
@article{arxiv.0807.2698,
title = {Mesoscopic model for mechanical characterization of biological protein materials},
author = {Gwonchan Yoon and Hyung-Jin Park and Sungsoo Na and Kilho Eom},
journal= {arXiv preprint arXiv:0807.2698},
year = {2008}
}
备注
29 pages; 7 figures; accepted for publication at Journal of Computational Chemistry