利用 steer 分子动力学对淀粉样蛋白 Abeta11-42 纤维进行机械拉伸
软凝聚态物质
2021-08-10 v2 材料科学
摘要
淀粉样 beta 纤维的机械强度已知与神经元细胞死亡相关。此处，我们借助 steered 分子动力学（SMD）模拟在真空中对单个 S 形淀粉样 beta Abeta11-42 十二聚体纤维进行机械拉伸。研究发现，由于机械延展而导致纤维断裂的最弱位点 exclusively 分布于整个纤维中丙氨酸与谷氨酸的界面处。研究还揭示，将纤维展开形成长线性构象所需的自由能等价于约 210 eV，比室温下的热电压大数千倍。因此，在溶液中基于淀粉样 beta 纤维因其疏水核与溶液熵之间的相互作用而结构更稳定这一事实，此类最大拉伸需要更大的自由能。
引用
@article{arxiv.2106.11966,
title = {Mechanical stretching of amyloid Abeta11-42 fibrils using steered molecular dynamics},
author = {Ashkan Shekaari and Mahmoud Jafari},
journal= {arXiv preprint arXiv:2106.11966},
year = {2021}
}