蛋白质统计力学模型的平均场方法

我们研究了Galzitskaya和Finkelstein提出的用于描述蛋白质折叠的基于拓扑的模型的热力学性质。我们为该模型设计并测试了三种不同的平均场方法，这些方法简化了处理过程而不破坏其描述能力。通过将模型及其平均场近似应用于免疫球蛋白结合蛋白(GB1)的$\beta$-发夹片段，并与现有实验数据和模拟结果进行比较，检验了模型及其平均场近似的有效性。我们的结果表明，只要仔细选择模型参数，该模型是解释折叠实验数据的一个相当简单且合理有效的工具。平均场方法基本上恢复了所有相关的精确结果，并代表了蒙特卡洛模拟的可靠替代方案。