基于 MARTINI“乐高”方法的多体耗散粒子动力学
计算物理
2024-06-25 v2 软凝聚态物质
摘要
MARTINI 是一种流行的粗粒化力场，主要用于分子动力学（MD）模拟。它基于“乐高”方法，其中代表不同极性化学单元的粗粒化珠之间的分子间相互作用通过水-辛醇分配系数获得。这使得仅使用有限数量的参数化粗粒化珠即可模拟广泛的分子，类似于乐高游戏中使用有限数量的积木创建更大的结构。此外，MARTINI 力场基于具有最短可能截断（包含吸引力）的 Lennard-Jones 势，因此对于 MD 模拟非常高效。然而，MD 模拟通常是一种计算昂贵的方法。在此，我们证明使用 MARTINI“乐高”方法适用于多体耗散粒子（MDPD）动力学，这是一种比 MD 快得多（约 4–7 倍）模拟多组分和多相软物质系统的方法。在本研究中，选择 DPPC 脂质双分子层来证明该方法的有效性，并比较各种性质以突出该方法的潜力。因此，我们预期我们的研究通过使用 MDPD 方法为更广泛软物质系统的更快模拟开辟了新可能。
引用
@article{arxiv.2310.06883,
title = {Many-Body Dissipative Particle Dynamics with the MARTINI "Lego" approach},
author = {Luis H. Carnevale and Panagiotis E. Theodorakis},
journal= {arXiv preprint arXiv:2310.06883},
year = {2024}
}
备注
9 pages, 5 figures