Martini 3 水混合物的表面张力
软凝聚态物质
2024-12-10 v1
摘要
Martini 模型是一种粗粒度力场,过去十年来获得了巨大的普及。其构建模块方法在计算效率与高化学特异性之间取得了平衡,使能够对各种有机和无机分子进行模拟。将粗粒度珠子建模为 Lennard-Jones 粒子在准确再现液-气界面属性方面存在挑战,这些属性在各种应用中至关重要,尤其是对于水的情况。最新版本的力场为水珠子引入了改进的相互作用参数,解决了 Martini 水在室温下冻结的已知问题。此外,还可用于模拟小腔道溶剂,包括蛋白质中最小的口袋。本工作侧重于研究 Martini 水的界面属性,包括表面张力、表面厚度以及液体和气相的体密度。采用 test-area 方法,我们系统地计算了在各种水珠子大小组合下以及温度范围在 300 到 350 K 之间的液-气表面张力。我们的发现为对 Martini 3.0 水界面属性提供了全面表征。这些发现对于 Martini 社区具有意义,因为它们允许用户通过适当调整粗粒度仿真计算的可观测量(例如毛细力)来考虑 Martini 水的低界面张力,从而实现与全原子或实验结果的准确匹配。表面张力数据也以 Gibbs 吸附形式解释为各种混合成分在液-气界面上的局部富集。
引用
@article{arxiv.2405.18970,
title = {The surface tension of Martini 3 water mixtures},
author = {Lorenzo Iannetti and Sonia Cambiaso and Fabio Rasera and Alberto Giacomello and Giulia Rossi and Davide Bochicchio and Antonio Tinti},
journal= {arXiv preprint arXiv:2405.18970},
year = {2024}
}
备注
32 pages, 9 tables, 7 figures