通过逆蒙特卡洛方法进行粗粒化：耗散粒子动力学模拟成为软物质建模的精确工具
软凝聚态物质
2007-05-23 v1
摘要
我们提出了一种有前景的粗粒化策略，用于连接软物质系统的微观和介观尺度。该方法基于从详细的原子级分子动力学(MD)模拟中获得的有效的两体相互作用势，然后将其用于粗粒化的耗散粒子动力学(DPD)模拟中。在这里，通过将逆蒙特卡洛方法[Lyubartsev和Laaksonen，Phys. Rev. E. vol. 52, 3730 (1995)]应用于以径向分布函数描述的选定的自由度子集，获得了有效的势能。在我们对该方法的首次应用中，有效势能用于水NaCl溶液的DPD模拟。在相同的计算工作量下，我们能够模拟比MD模拟大一个数量级的系统。发现MD和DPD模拟的结果非常一致。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0303583,
title = {On coarse-graining by the Inverse Monte Carlo method: Dissipative Particle Dynamics simulations made to a precise tool in soft matter modeling},
author = {A. P. Lyubartsev and M. Karttunen and I. Vattulainen and A. Laaksonen},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0303583},
year = {2007}
}