MAD-FC:具备可读性、比例性与对称性的倍数变化可视化
图形学
2023-03-21 v1 定量方法
摘要
我们提出了一种倍数变化可视化方法,其展现了倍数变化对数图与线性图特性的结合。一种有用的倍数变化可视化可具备:(1) 可读性,即倍数变化值可从数据点位置恢复;(2) 比例性,即同方向的倍数变化值与无变化点的距离为成比例;(3) 对称性,即正、负倍数变化到无变化点等距;以及 (4) 高动态范围,即数据点值跨数量级可辨。线性可视化具备可读性和部分比例性,但缺乏高动态范围和对称性(因为负向倍数变化被限制在 [0, 1],而正向在 [1, ))。倍数变化对数图具有部分可读性、高动态范围和对称性,但因对数变换而缺乏比例性。我们概述了一种新的变换与可视化,称为倍数变化镜像轴畸变(MAD-FC),它将倍数变化数据的线性可视化扩展以具备可读性、比例性和对称性(但仍具有线性图有限的动态范围)。我们使用多种倍数变化图表以生物医学数据说明了 MAD-FC 的应用。我们认为,对于需要有限动态范围(约 2 个数量级或 log2 空间中 8 单位)的应用,MAD-FC 图可能比对数图或线性图更有用。
引用
@article{arxiv.2303.10829,
title = {MAD-FC: A Fold Change Visualization with Readability, Proportionality, and Symmetry},
author = {Bruce A. Corliss and Yaotian Wang and Francis P. Driscoll and Heman Shakeri and Philip E. Bourne},
journal= {arXiv preprint arXiv:2303.10829},
year = {2023}
}