RLE 图:高维数据中非期望变异的可视化
统计方法学
2018-07-04 v1
摘要
非期望变异可能极具问题性,因此其检测通常至关重要。相对对数表达 (RLE) 图是可视化高维数据中此类变异的有力工具。我们借助实例和模拟对这些图进行了详细考察,阐释其是什么以及能揭示什么。RLE 图特别适用于评估旨在消除非期望变异的程序(即归一化程序)是否成功。这些图虽然最初是为微阵列的基因表达数据而设计,但也可用于揭示许多其他类型高维数据中的非期望变异,此类变异可能带来问题。
引用
@article{arxiv.1704.03590,
title = {RLE Plots: Visualising Unwanted Variation in High Dimensional Data},
author = {Luke C. Gandolfo and Terence P. Speed},
journal= {arXiv preprint arXiv:1704.03590},
year = {2018}
}
备注
9 pages, 3 figures