多序列比对直接耦合分析的液体理论类比及其对蛋白质结构预测的启示
生物大分子
2015-12-15 v2
摘要
直接耦合分析是一种强大的蛋白质接触预测方法，使我们能够从多序列比对中观测到的"间接"相关性中提取潜伏在其中的远距离位点之间的"直接"相关性。我证明直接相关性可以通过使用类似于液体理论中 Ornstein-Zernike 积分方程的公式来获得。该公式直观地展示了间接或表观相关性如何由直接相关性的无穷级数产生，并为蛋白质结构预测提供了有趣的见解。
引用
@article{arxiv.1510.06794,
title = {Liquid-theory analogy of direct-coupling analysis of multiple-sequence alignment and its implications for protein structure prediction},
author = {Akira R. Kinjo},
journal= {arXiv preprint arXiv:1510.06794},
year = {2015}
}
备注
3 pages, 1 figure