LinkedNN：基于神经网络的链位锁定不平衡衰减模型，用于近期有效种群大小推断
种群与进化
2026-02-16 v1 定量方法
摘要
概述：本文提出了一种生物信息学工具，用于通过神经网络自动计算连锁不平衡相关特征（作为基因组距离函数），从而估计近期有效种群大小。该新方法在样本数较少的序列个体和变异位点的情况下，优于现有的深度学习和摘要统计方法，特别适用于稀疏、未分相数据的分子生态学应用。可用性与实现：该程序作为易于安装的 Python 软件包提供，文档链接：https://pypi.org/project/linkedNN/。开源代码可在：https://github.com/the-smith-lab/LinkedNN 获取。
引用
@article{arxiv.2602.13121,
title = {LinkedNN: a neural model of linkage disequilibrium decay for recent effective population size inference},
author = {Chris C R Smith},
journal= {arXiv preprint arXiv:2602.13121},
year = {2026}
}