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配体诱导的耦合与受体预成聚:FGF-2结合的细胞自动机模拟

统计力学 2007-05-23 v1 软凝聚态物质 生物物理 亚细胞过程

摘要

基本成纤维细胞生长因子(FGF-2)与其细胞表面受体(CSR)及后续信号传导已知会受到肝素硫酸酯蛋白(HSPG)的增强。HSPG以较低亲和力结合FGF-2,可能通过与配体和受体均关联,稳定FGF-2-CSR复合物来影响CSR介导的信号传导。然而,HSPG是否在FGF-2不存在时与CSR共聚尚未知晓。本文通过假设扩散限制的表面反应,确定HSPG预成聚对CSR-FGF-2-HSPG三元组形成条件。我们使用平均场速率方程显示:(i)当[HSPG]远高于[CSR]时,预成形复合物的存在不会影响FGF-2结合的稳态;(ii)当浓度相当时,预成形复合物的存在显著增加CSR结合FGF-2的稳态浓度。这些发现得到明确的细胞自动机模拟支持,合理了平均场处理方法。我们讨论了在参数相当时,二受体系统相对于单受体模型的优势。进一步地,我们推测完整细胞中HSPG的高浓度([HSPG]≈100[CSR])提供了一种方式,确保FGF-2与其信号受体的结合水平保持高水平, regardless of 细胞表面预成形CSR-HSPG复合物的存在,同时允许细胞通过下调信号受体来微调对FGF-2的响应。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0308348,
  title  = {Ligand-induced Coupling versus Receptor Pre-association: Cellular automaton simulations of FGF-2 binding},
  author = {Manoj Gopalakrishnan and Kimberly Forsten-Williams and Uwe C. Tauber},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0308348},
  year   = {2007}
}

备注

32 pages, 9 figures included, submitted to J. Theor. Biol