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蛋白质中性演化中自平均的缺失

凝聚态物理 2009-11-07 v1 种群与进化

摘要

我们在折叠热力学有效模型的框架内,施加天然态热力学稳定性的守恒约束,模拟了蛋白质的中性演化。这一过程在序列空间中生成的演化轨迹,对于所有被考察的蛋白质都具有两个普遍特征。首先,中性突变的数量在不同序列间波动很大,导致非 Poisson 替换过程。其次,中性突变的数量沿轨迹表现出强相关性,从而导致所得演化替换过程自平均的破缺。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0209453,
  title  = {Lack of self-averaging in neutral evolution of proteins},
  author = {Ugo Bastolla and Markus Porto and H. Eduardo Roman and Michele Vendruscolo},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0209453},
  year   = {2009}
}

备注

4 pages, 2 figures