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受限空间中随机环聚合物的结 knotting

软凝聚态物质 2009-11-11 v1 统计力学

摘要

使用随机模拟方法对受限于不同半径的球体内的随机环聚合物结 knotting 分布进行表征。该方法基于多重马尔可夫链和重新加权技术,结合简化环构象几何复杂度的有效策略,而不改变其结类型。通过这些方法,我们扩展了前期研究,详细描述了给定的素数或复合结形成概率随环段数 NN 与约束半径 RR 的行为。对于 50N45050 \le N \le 450,我们发现形成复合结的概率随约束条件而显著增加,而素数结的出现概率一般是 1/R1/R 的非单调函数。还描述了其他几何指标(如 writhe 与手性)随 RRNN 的依赖关系。结果表明,随着约束球体缩小,writhe 分布的宽度会加大。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0512271,
  title  = {Knotting of random ring polymers in confined spaces},
  author = {C. Micheletti and D. Marenduzzo and E. Orlandini and D. W. Sumners},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0512271},
  year   = {2009}
}

备注

32 pages, 14 figures. Accepted for publication in J. Chem. Phys