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分子生物芯片上结合动力学与细胞几何形状

定量方法 2011-04-05 v1

摘要

我们研究了分子生物芯片上靶分子与探针分子结合时,细胞形状和实验几何结构对反应-扩散动力学的影响。具体而言,我们比较了固定在半球形和平坦圆形细胞表面的探针、探针细胞上方分析物溶液薄板极限,以及基底上半球形凝胶垫和印在凝胶板中的细胞的结合动力学。结果表明,半球形几何结构提供了显著更快的结合动力学,并确保了在瞬态过程中局部(来自像素)信号在细胞上更均匀的空间分布。使用具有小体积分析物溶液的薄板的优势,可能会因需要辅助混合设备的更长结合动力学而受到阻碍。我们的分析证明,细胞的形状和实验的几何结构应被列入生物芯片设计的基本因素之中。

关键词

引用

@article{arxiv.1104.0543,
  title  = {Kinetics of binding and geometry of cells on molecular biochips},
  author = {V. R. Chechetkin},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1104.0543},
  year   = {2011}
}

备注

10 pages, 1 figure