缺外切酶 DNA 聚合酶的动力学与热力学
亚细胞过程
2018-01-04 v1 生物物理
摘要
基于实验观察到速率不仅依赖于新掺入的核苷酸，也依赖于前一个核苷酸，从而导致了从伯努利模板生长出马尔可夫型 DNA 序列，我们为缺外切酶 DNA 聚合酶建立了动力学理论。对核苷酸浓度与模板序列的依赖性被显式考虑。在此框架下，DNA 复制的动力学与热力学性质，特别是以速率常数和浓度为表征的平均生长速度、错误概率以及熵产生，被解析地算出。该理论与针对 T7 噬菌体和人类线粒体的 DNA 聚合酶的数值模拟进行了比较。
关键词
引用
@article{arxiv.1604.02553,
title = {Kinetics and thermodynamics of exonuclease-deficient DNA polymerases},
author = {Pierre Gaspard},
journal= {arXiv preprint arXiv:1604.02553},
year = {2018}
}
备注
Physical Review E (2016)