非酶分子复制子的生长速率
生物大分子
2015-05-27 v2 统计力学
生物物理
化学物理
摘要
众所周知，非酶模板定向分子复制子X + nO ---> 2X表现出抛物线增长d[X]/dt = k [X]^{1/2}。在这里，我们分析了有效复制速率常数k对杂交能量、温度、链长和序列组成的依赖性。首先，我们基于简单的热力学论证推导了复制速率k的分析标准。其次，我们提出了一个寡核苷酸的布朗动力学模型，该模型允许我们模拟其扩散和杂交行为。该模拟用于生成和分析链长、温度以及在某种程度上序列组成对杂交速率和由此产生的最佳总体速率常数k的影响。结合这两种方法，我们可以半解析地描绘出模板定向复制子的适应度景观。结果表明，在低温下，较长的链具有明显的复制优势。
引用
@article{arxiv.1103.5301,
title = {On the Growth Rate of Non-Enzymatic Molecular Replicators},
author = {Harold Fellermann and Steen Rasmussen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1103.5301},
year = {2015}
}
备注
Submitted to: Entropy