模型核苷酸序列中的反向与镜像重复
基因组学
2009-11-13 v1 定量方法
摘要
我们通过解析和数值方法研究核酸模型序列中反向重复与镜像重复的概率特性。我们同时考虑了完美重复与非完美重复，即存在错配和空位的重复。所考虑的序列模型包括独立同分布（i.i.d.）序列、马尔可夫过程以及长程序列。我们表明，在相关序列中重复的数量显著多于独立同分布序列，且对于长程序列，这种差异随重复长度的增加呈指数级扩大。
引用
@article{arxiv.0705.2143,
title = {Inverted and mirror repeats in model nucleotide sequences},
author = {Fabrizio Lillo and Marco Spanó},
journal= {arXiv preprint arXiv:0705.2143},
year = {2009}
}
评论
12 pages, 6 figures