Ins-ATP:基于高通量显微图像的类器官 ATP 深度估计方法
计算机视觉与模式识别
2023-03-16 v2
摘要
三磷酸腺苷(ATP)是一种高能磷酸化合物,也是生物体内最直接的能力来源。ATP 是生物学中评估细胞活力的关键生物标志物。研究者常利用 ATP 生物发光法测量给药后类器官的 ATP 以评价药效。然而,ATP 生物发光法存在若干局限,导致药物筛选结果不可靠。实施 ATP 生物发光会造成类器官细胞裂解,因而无法持续观察给药后类器官的长期活力变化。为克服 ATP 生物发光法的缺陷,我们提出 Ins-ATP——一种非侵入策略,也是首个基于高通量显微图像的类器官 ATP 估计模型。Ins-ATP 直接从高通量显微图像估计类器官 ATP,故不影响类器官的药物反应,从而可长期观察类器官 ATP 变化以获得更稳健的结果。实验表明,Ins-ATP 的 ATP 估计与 ATP 生物发光法测定值吻合良好;具体而言,在不同药物药效评价实验中,Ins-ATP 的预测与 ATP 生物发光法测量结果一致。
引用
@article{arxiv.2303.06796,
title = {Ins-ATP: Deep Estimation of ATP for Organoid Based on High Throughput Microscopic Images},
author = {Xuesheng Bian and Cheng Wang and Shuting Chen and Weiquan Liu and Sen Xu and Jinxin Zhu and Rugang Wang and Zexin Chen and Min Huang and Gang Li},
journal= {arXiv preprint arXiv:2303.06796},
year = {2023}
}