多物种 coalescent 下的仲系树的不一致性

虽然已知在某些进化模型下由于高水平的同形性，仲系树在统计上可能不一致，但在多物种 coalescent (MSC) 下的仲系树一致性研究较少。以前的研究在 MSC 下证明了拼接仲系树（应用于拼接对齐序列的仲系树）在根 4- Taxa 情况下（使用无限-靶模型）下是一致的；另一方面，其他工作也证明了拼接仲系树在非根 6- Taxa 情况下是不一致的。这些看似矛盾的结果表明，对于超过 5 个 Taxa 的树，或所有非根树，或上述两种情况的某种组合，拼接仲系树可能失败。本文提出了一种计算 MSC 下基因树内部分支长度的技术。该技术允许我们确定不同 Taxa 数量下，针对根或非根树，拼接仲系树在哪些参数空间中会失败。我们利用新方法表明，虽然仲系树在非根 5- Taxa 情况下成功，但在根 5+ Taxa 情况和非根 6+ Taxa 情况中存在统计不一致的区域。我们的結果表明，仲系树在 MSC 下并非普遍可靠。