生物膜早期形成的计算机模拟建模
软凝聚态物质
2021-01-26 v1
摘要
若干细菌和菌链在不同环境条件下（如 pH、温度、营养等）形成生物膜。因此，生物膜生长是一个极具鲁棒性的过程。正因如此，尽管生物膜生长是受多个变量影响的复杂过程，但研究简单的示意性模型可获得对生物膜形成的深入认识。在本稿件中，我们描述了一种混合分子动力学与蒙特卡洛模型，用于模拟生物膜的早期形成，以明确证明有可能涵盖大多数预期相关的过程。模拟考虑了细菌的生长与繁殖、其相互作用与运动性、胞外聚合物的合成以及 Psl 轨迹。我们描述了这些过程对二维生物膜早期形成的影响，并讨论了初步的三维结果。
引用
@article{arxiv.2101.10199,
title = {In-silico modeling of early-stage biofilm formation},
author = {Pin Nie and Francisco Alarcon Oseguera and Ivan Lopez-Montero and Belen Orgaz and Chantal Valeriani and Massimo Pica Ciamarra},
journal= {arXiv preprint arXiv:2101.10199},
year = {2021}
}
备注
This article has been accepted for publication in Soft Materials, published by Taylor & Francis