液面生物膜形成的基于个体模型
细胞行为
2015-12-16 v1 软凝聚态物质
斑图形成与孤子
摘要
细菌 {\em Bacilus subtilis} 经常在培养基与空气界面形成生物膜。我们开发了一个数学模型，将细菌描述为离散个体对象，并与环境的标准平流-扩散方程耦合。模型考虑两种不同的细菌表型。在运动状态下，细菌游动并执行向高氧浓度区域偏置的跑-翻运动（趋氧性）。在基质产生状态下，它们分泌胞外聚合物，使其能与其他细菌连接形成生物膜。细菌也被流体平流，并能触发生物对流。模型的数值模拟再现了实验室实验观察到的生物膜形成所有阶段。最后，我们研究各种模型参数对生物膜动力学和形态的影响。
引用
@article{arxiv.1512.04697,
title = {An individual-based model for biofilm formation at liquid surfaces},
author = {Maxime Ardré and Hervé Henry and Carine Douarche and Mathis Plapp},
journal= {arXiv preprint arXiv:1512.04697},
year = {2015}
}
备注
33pages, 8 figures. pdflatex