通过受控词表嵌入识别转化科学

目的：转化科学旨在将基础科学发现“转化”为临床应用。转化科学的识别具有实际意义，例如评估对诸如临床与转化科学奖励（Clinical and Translational Science Awards）等大型项目的投入成效。尽管已有若干将出版物（研究产出的基本单元）分组为某些类别的方法，我们仍缺乏一种将论文置于从基础研究到临床医学的完整连续谱上的定量方法。方法：在此，我们学习分配给 MEDLINE 论文的受控词表的向量表示，以获得一条从基础科学指向临床医学的转化轴（Translational Axis, TA）。术语在 TA 上的投影位置由连续量表示，指示该术语的“应用程度”。论文的位置由其各术语位置的平均值确定，量化其“应用程度”的程度，我们称之为“水平分数”。结果：我们通过与先前技术比较验证了我们的方法，显示出极好的一致性，但也揭示了先前定义类别中论文分数的显著变异。该度量使我们能够刻画期刊、学科以及整个生物医学文献在基础—应用谱上的地位。对大规模引文网络的分析揭示了两个主要发现。第一，直接引用主要发生在分数相近的论文之间。第二，最短路径更可能以谱中更接近基础端的论文结束，无论起始论文在谱上何处。结论：所提方法提供了一种识别转化科学的定量途径。