化学反应网络的超图定向拟阵关系依赖流模型

C. G. Bailey; D. W. Gull; J. S. Oliveira

化学反应网络的超图定向拟阵关系依赖流模型

组合数学 2009-02-06 v1 定量方法

作者: C. G. Bailey , D. W. Gull , J. S. Oliveira

摘要

在本文中，我们推导并展示了超图定向拟阵的一个应用，用于枚举定义与非线性动力学系统表示的化学动力学反应流网络相关的化学复合物的变量相互依赖性。通过定义带符号多重集的n-子集族上的闭包算子，得到了一个“Z-模”，从而推导出超图定向拟阵。已经观察到，闭包算子在带符号多重集族上的每一次实例化都定义了一个拟阵结构。然后证明这些结构生成一对对偶拟阵，分别对应于从相应有向超图获得的超支撑树和超环。接下来系统地评估这些结构，以获得满足MAP激酶级联细胞信号通路中非线性化学动力学反应流网络系统的解集。

关键词

超图定向拟阵化学反应网络闭包算子带符号多重集对偶拟阵 MAP激酶级联

引用

@article{arxiv.0902.0847,
  title  = {Hypergraphic Oriented Matroid Relational Dependency Flow Models of Chemical Reaction Networks},
  author = {C. G. Bailey and D. W. Gull and J. S. Oliveira},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0902.0847},
  year   = {2009}
}

备注

16 pages, 4 figures

化学反应网络的超图定向拟阵关系依赖流模型

摘要

关键词

引用

备注

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