宿主-寄生虫共同进化与半保守准种的优化突变率

在本文中，我们扩展了宿主-寄生虫共同进化模型，以纳入宿主和寄生虫DNA复制的半保守性质。我们发现，对于现实的基因组长度，半保守和保守宿主的优化突变率趋于一致，从而保持了先前保守模型中发现的理论与实验之间的显著一致性，并在某些情况下证明了保守近似的合理性。我们证明，虽然与给定免疫系统相互作用的保守和半保守寄生虫的优化突变率与保守寄生虫相似，但远离该最优值的性质却显著不同。我们怀疑这种差异，加上寄生虫需要在各种可行宿主范围内优化生存的要求，可能有助于解释为什么已知半保守病毒的突变率显著低于其保守对应物。