表型混合与隐藏可能有助于病毒准种的记忆
生物物理
2007-05-23 v1 软凝聚态物质
适应与自组织系统
种群与进化
摘要
背景。在最近许多关于口蹄疫病毒的实验中,发现一种有害突变体能够避免灭绝并在群体中存留很长时间。这一观察被称为准种记忆。准种记忆的起源尚未完全明了。结果。我们提出并分析了一个简单的模型,描述野生型病毒与一个细胞进入能力受损的突变体之间的互补作用。除非通过突变从野生型重新产生,否则该突变体将灭绝。然而,在表型混合-隐藏作为互补机制下,无突变情况下的灭绝时间随着感染复数(m.o.i.)的增加而增加。在选择-突变平衡下,突变体的平衡频率也随m.o.i.的增加而增加。在高m.o.i.下,大部分突变体基因组被野生型蛋白包裹,使其能像野生型病毒粒子一样有效地感染细胞,从而将其适合度提高到野生型水平。此外,即使在低m.o.i.下,突变体的平衡频率也高于标准准种模型的预测,因为从野生型亲本产生的一部分突变体病毒粒子也将被野生型蛋白包裹。结论。我们的模型预测,表型隐藏将强烈影响病毒的群体动态,特别是在高m.o.i.下,并且在低m.o.i.下对突变-选择平衡也有重要影响。突变体灭绝的延迟和平衡频率的增加可能至少部分解释了准种群体的记忆。
引用
@article{arxiv.physics/0306184,
title = {Phenotypic mixing and hiding may contribute to memory in viral quasispecies},
author = {Claus O. Wilke and Isabel S. Novella},
journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0306184},
year = {2007}
}
备注
10 pages pdf, as published by BMC