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由大量不同组分类型构建的平衡结构的生长

软凝聚态物质 2014-08-25 v1 统计力学

摘要

我们使用简单的解析论证和基于格点的计算机模拟,研究了由大量不同组分类型构建的结构的生长。组分具有“设计”相互作用,旨在稳定一个平衡目标结构,其中每种组分类型都有确定的空间位置;以及“非设计”相互作用,允许组分以成分无序的方式结合。我们发现,只要设计相互作用集的能量尺度选择得当,即使存在显著吸引性的非设计相互作用,平衡目标结构的高保真生长也能发生。这一观察结果可能有助于解释为什么即使非设计相互作用未被抑制,平衡DNA“砖块”结构也能自组装[Ke et al. Science 338, 1177 (2012)]。我们还发现,当设计相互作用来自尽可能窄的分布时,目标结构的高保真生长最有可能发生。我们利用这一结果建议如何选择互补DNA序列,以最大化由互补DNA相互作用介导的多组分自组装的保真度。我们还评论了以这种方式生长宏观结构的前景。

关键词

引用

@article{arxiv.1405.2145,
  title  = {Growth of equilibrium structures built from a large number of distinct component types},
  author = {Lester O. Hedges and Ranjan V. Mannige and Stephen Whitelam},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1405.2145},
  year   = {2014}
}

备注

13 pages, 10 figures